Sono aperte le iscrizioni per la seconda edizione della Bologna Summer School of Genome Regulation, una scuola estiva di cinque giorni organizzata da Fondazione Golinelli e G-Lab S.r.l. Impresa Sociale in collaborazione con Alessandro Gardini, professore associato in Genome Regulation and Cell Signaling al The Wistar Institute (Philadelphia) e Giovanni Perini, Professore di Genetica all’Università di Bologna.
Un’esperienza formativa intensiva che si svolgerà a Opificio Golinelli dal 13 al 17 luglio 2026 e che integrerà lezioni teoriche sulle tecnologie genomiche più avanzate con seminari di ricercatori leader nel campo della biologia genomica, ed esercitazioni pratiche di bioinformatica.
Il programma coprirà i temi delle tecnologie di sequenziamento high-throughput di DNA e RNA, dei principi di epigenomica e trascrittomica e dell’organizzazione 3D del genoma.
OBIETTIVI
La regolazione dell’espressione genica è il pilastro di tutti processi di sviluppo cellulare ed è cruciale per mantenere l’omeostasi di tessuti e cellule. Difetti di espressione genica sono alla base di malattie ereditarie e sporadiche, dal cancro ai disturbi neurodegenerativi. Nell’attuale era genomica, le piattaforme sperimentali per studiare l’espressione genica sono accessibili a ricercatrici e ricercatori del settore biomedicale, tuttavia l’analisi bioinformatica dei grandi dataset genomici/epigenomici/trascrittomici rappresenta ancora un ostacolo per chi fa ricerca.
La Summer School in Genome Regulation è un workshop intensivo per giovani scienziati/e nel campo biomedico, interessati ad approfondire i principi molecolari di trascrizione, epigenetica e organizzazione del nucleo cellulare. Oltre a seminari e lezioni teoriche, la scuola offrirà agli studenti una formazione pratica sull’analisi bioinformatica di un’ampia gamma di dataset genomici (ad esempio: ChIP-seq, CUT&TAG, ATAC-seq, single cell RNA-seq, Hi-C).
DESTINATARI
- Studentesse e studenti laureate/i (attualmente iscritti a un programma di dottorato in scienze biologiche e biomediche), ricercatori post-dottorato e scienziati senior.
- Una laurea è un requisito minimo, preferibile un master.
- Sono richieste conoscenze di base di biochimica, genetica, biologia molecolare e principi di base della biostatistica.
- Il corso è progettato per partecipanti con competenze informatiche di base. Sebbene non sia richiesta una conoscenza preliminare della biologia computazionale, è apprezzata familiarità con la shell Linux e l’ambiente R.
PROGRAMMA
La scuola estiva durerà da lunedì 13 luglio 2026, alle ore 9, a venerdì 17 luglio 2026, alle ore 18.
Al mattino si svolgeranno le lezioni teoriche e i seminari con relatori e relatrici, tra cui Maria Cristina Gambetta (Università di Losanna), Giovanni Tonon (Istituto San Raffaele), Yang Shi (Università di Oxford), Ali Shilatifard (Feinberg School of Medicine), Didier Trono (École Polytechnique Fédérale de Lausanne). mentre nel pomeriggio saranno in programma dry lab di bioinformatica, discussione e presentazione dei risultati.
Tra i temi scientifici trattati:
- regolazione epigenomica,
- trascrizione ed elaborazione del RNA,
- genoma 3D e Single Cell Omics.
I laboratori di bioinformatica approfondiranno:
- mapping, annotation and statistical analysis of histone marks, DNA methylation and transcription factors ( CUT&TAG, CUT&RUN, ChIP-seq)
- analysis of bulk RNA-seq datasets: from differential gene expression to correlation with the epigenome states
- pathway analysis and GSEA
- mapping and annotation of Hi-C datasets
- analysis of enhancer-promoter loops in mammalian cells
- principles of scRNAseq: clustering and pseudotime analysis
ISCRIZIONI
Le iscrizioni sono aperte dal 12 gennaio fino al raggiungimento del numero massimo di partecipanti (e comunque non oltre il 30 maggio 2025).
La partecipazione è limitata a 40 partecipanti. La scuola sarà attivata con un minimo di 25 partecipanti. Una volta raggiunto il numero minimo di partecipanti, alle persone selezionate saranno inviate le istruzioni per il pagamento.
Il costo d’iscrizione è di 750 euro, escluso l’alloggio e i costi di viaggio. Sono inclusi nel costo d’iscrizione i corsi, i seminari, i laboratori, i pranzi, i coffee break e la cena di fine corso. Fondazione Golinelli ha stipulato delle convenzioni con alberghi nei pressi di Opificio Golinelli. Maggiori informazioni saranno fornite in fase d’iscrizione.
Le partecipanti e i partecipanti dovranno essere muniti di computer. In caso contrario, ne sarà fornito uno su richiesta, da inoltrare al momento dell’iscrizione. Per tutta la durata della Summer School avranno accesso a un cloud per svolgere le attività.
INFORMAZIONI
altaformazione@g-lab.eu